L'Institut propose 3 filières de formation afin de préparer des étudiants aptes à travailler dans tous les niveaux des structures statistiques. La durée de la formation varie de 1 à 5 ans selon les filières
Techniciens Supérieurs de la Statistique (TSS)
L’ISSEA forme en deux ans des techniciens supérieurs de la statistique dont le rôle consiste à utiliser l'information statistique pour la préparation des décisions de nature économique ou sociale concernant la nation, la région ou l'entreprise.
Ingénieur Statisticien Economiste (ISE)
L’ISSEA forme en cinq ans des Ingénieurs statisticiens économistes dont le rôle consiste à créer, gérer et utiliser l'information statistique pour la préparation des décisions de nature économique ou sociale concernant la nation, la région ou l'entreprise.
Analyste Statisticien (AS)
La formation des Analystes Statisticien, orientée vers les techniques appliquées de la statistique et de l’économie, dure 3 ans. Elle est sanctionnée par le diplôme d'Analyste Statisticien.