L’ISSEA a pour missions :
- La formation initiale des cadres statisticiens et économistes ;
- Le recyclage et le perfectionnement (formation continue) ;
- La recherche appliquée.
La formation des cadres statisticiens est assurée par la Direction des Etudes (DIRE) qui comprend deux départements : le Département Statistique et le Département Economie. Par le biais de cette mission, l'ISSEA forme et met chaque année à la disposition des Etats des Techniciens Supérieurs de la Statistique, des Ingénieurs d’application de la Statistique et des Ingénieurs Statisticiens Economistes.
Pour ce qui est de la formation continue, elle est chargée du recyclage et du Perfectionnement des professionnels des administrations publiques et privées. Ses actions visent à améliorer les connaissances de statisticiens, d’économistes et d’autres spécialités et à faire découvrir des techniques récentes de production et d’analyse de l’information. Elle comprend deux départements à savoir le Département de la Formation Continue Diplômante et le Département de la Formation Continue Qualifiante.
La mission de la recherche appliquée est assurée par la Direction de la Recherche Appliquée et de la Coopération (DIRAC). Elle coordonne les activités d’enquête, propose des pistes de recherche dans le domaine des systèmes d’information, propose des projets de colloques et entreprend des activités de coopération et en propose les projets y relatifs aux instances de direction de l’Institut. La DIRAC comprend deux départements qui sont le Département des projets de recherche et de la coopération, et le Département des enquêtes statistiques et de la publication.